Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
LAPTM4AQ15012 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
LAPTM4AQ15012 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAPTM4AQ15012 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LAPTM4AQ15012 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LAPTM4AQ15012 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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