Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TRIM25Q14258 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRIM25Q14258 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRIM25Q14258 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRIM25Q14258 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRIM25Q14258 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM25Q14258 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM25Q14258 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
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