Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
EFR3AQ14156 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
EFR3AQ14156 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EFR3AQ14156 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EFR3AQ14156 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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