Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PDE6HQ13956 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PDE6HQ13956 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
PDE6HQ13956 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
PDE6HQ13956 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
PDE6HQ13956 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
PDE6HQ13956 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
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