Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

Predictions only

Length 603 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MTM1Q13496 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MTM1Q13496 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
MTM1Q13496 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MTM1Q13496 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
MTM1Q13496 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
MTM1Q13496 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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