Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
MKRN4PQ13434 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
MKRN4PQ13434 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
MKRN4PQ13434 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
MKRN4PQ13434 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
MKRN4PQ13434 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
MKRN4PQ13434 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
MKRN4PQ13434 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms