Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.15■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
TRDNQ13061 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.13■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
TRDNQ13061 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
TRDNQ13061 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
TRDNQ13061 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
TRDNQ13061 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC30.84■■■□□ 2.53
TRDNQ13061 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
TRDNQ13061 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
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