Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GTF3C1Q12789 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GTF3C1Q12789 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GTF3C1Q12789 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GTF3C1Q12789 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GTF3C1Q12789 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
GTF3C1Q12789 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
GTF3C1Q12789 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
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