Protein–RNA interactions for Protein: Q12200

NCR1, NPC intracellular cholesterol transporter 1-related protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NCR1Q12200 END3YNL084C 1050 nt10.86□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 YPL041CYPL041C 624 nt10.86□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 APM1YPL259C 1428 nt10.84□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 YFR045WYFR045W 930 nt10.84□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 MCH5YOR306C 1566 nt10.84□□□□□ -0.67
NCR1Q12200 RRT6YGL146C 936 nt10.83□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 LSC2YGR244C 1284 nt10.83□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 TIF6YPR016C 738 nt10.83□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 YKR015CYKR015C 1707 nt10.83□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 BOR1YNL275W 1731 nt10.82□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 MAF1YDR005C 1188 nt10.82□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 GET2YER083C 858 nt10.82□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 ERJ5YFR041C 888 nt10.82□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 NDL1YLR254C 570 nt10.82□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 SHE9YDR393W 1371 nt10.81□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 CSL4YNL232W 879 nt10.81□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 FTH1YBR207W 1398 nt10.8□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 YEA4YEL004W 1029 nt10.8□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 YEL050W-AYEL050W-A 192 nt10.8□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 YLR437C-AYLR437C-A 228 nt10.8□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 VAC17YCL063W 1272 nt10.79□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 UTH1YKR042W 1098 nt10.79□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 YML089CYML089C 369 nt10.79□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 YMR187CYMR187C 1296 nt10.79□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 COG5YNL051W 1212 nt10.79□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 BNS1YGR230W 414 nt10.78□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 TAF4YMR005W 1167 nt10.78□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 YMR147WYMR147W 672 nt10.78□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 ARC35YNR035C 1029 nt10.78□□□□□ -0.68
NCR1Q12200 THI80YOR143C 960 nt10.76□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 ATG15YCR068W 1563 nt10.75□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 TAP42YMR028W 1101 nt10.75□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 NRT1YOR071C 1797 nt10.75□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 DLD2YDL178W 1593 nt10.74□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 PLB1YMR008C 1995 nt10.74□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 YLR111WYLR111W 333 nt10.74□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 SAM1YLR180W 1149 nt10.74□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 RAD23YEL037C 1197 nt10.73□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 YGR012WYGR012W 1182 nt10.73□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 RSF1YMR030W 1131 nt10.73□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 ATG29YPL166W 642 nt10.73□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 COA2YPL189C-A 207 nt10.73□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 GAP1YKR039W 1809 nt10.72□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 snR56snR56 88 nt10.72□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 MET28YIR017C 564 nt10.72□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 YLR279WYLR279W 390 nt10.72□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 MER1YNL210W 813 nt10.72□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 SDH5YOL071W 489 nt10.72□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 PCI8YIL071C 1335 nt10.71□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 YMR181CYMR181C 465 nt10.71□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 TSC10YBR265W 963 nt10.71□□□□□ -0.69
NCR1Q12200 IRC9YJL142C 393 nt10.7□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt10.7□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 LIP1YMR298W 453 nt10.7□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 RTN2YDL204W 1182 nt10.69□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 SRT1YMR101C 1032 nt10.69□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 TRM10YOL093W 882 nt10.69□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 POP4YBR257W 840 nt10.69□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 COG1YGL223C 1254 nt10.68□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 MSB4YOL112W 1479 nt10.68□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 BRL1YHR036W 1416 nt10.67□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 YDR029WYDR029W 315 nt10.67□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 RIB3YDR487C 627 nt10.67□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 YPL068CYPL068C 882 nt10.67□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 RTG3YBL103C 1461 nt10.67□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 YKR005CYKR005C 1578 nt10.66□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 SCO2YBR024W 906 nt10.66□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 LEU2YCL018W 1095 nt10.66□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 RAD51YER095W 1203 nt10.65□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 CTR1YPR124W 1221 nt10.65□□□□□ -0.7
NCR1Q12200 HSP60YLR259C 1719 nt10.64□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 YDR541CYDR541C 1035 nt10.64□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 YKR104WYKR104W 921 nt10.64□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 YMR114CYMR114C 1107 nt10.64□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 IDP3YNL009W 1263 nt10.64□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 JJJ3YJR097W 519 nt10.63□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 SPC42YKL042W 1092 nt10.63□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 YOL106WYOL106W 354 nt10.63□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 TFB4YPR056W 1017 nt10.63□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 SLI1YGR212W 1407 nt10.62□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 RRF1YHR038W 693 nt10.62□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 DIF1YLR437C 402 nt10.62□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 YGR259CYGR259C 441 nt10.61□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 YLR407WYLR407W 687 nt10.61□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 ESC2YDR363W 1371 nt10.61□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 UTR1YJR049C 1593 nt10.6□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 FSH1YHR049W 732 nt10.6□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 snR34snR34 203 nt10.6□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 VAM3YOR106W 852 nt10.59□□□□□ -0.71
NCR1Q12200 YFL019CYFL019C 354 nt10.58□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 YLR198CYLR198C 360 nt10.58□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 DID2YKR035W-A 615 nt10.57□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 REC114YMR133W 1287 nt10.57□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 FIT3YOR383C 615 nt10.57□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 PRP4YPR178W 1398 nt10.56□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 CDA2YLR308W 939 nt10.56□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 PEX12YMR026C 1200 nt10.56□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 YTH1YPR107C 627 nt10.56□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 MTG2YHR168W 1557 nt10.56□□□□□ -0.72
NCR1Q12200 GAT1YFL021W 1533 nt10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 94 ms