Protein–RNA interactions for Protein: Q08AH1

ACSM1, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM1Q08AH1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ACSM1Q08AH1 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ACSM1Q08AH1 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ACSM1Q08AH1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ACSM1Q08AH1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ACSM1Q08AH1 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ACSM1Q08AH1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms