Protein–RNA interactions for Protein: Q07869

PPARA, Peroxisome proliferator-activated receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARAQ07869 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC31.32■■■□□ 2.61
PPARAQ07869 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
PPARAQ07869 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
PPARAQ07869 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
PPARAQ07869 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPARAQ07869 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
PPARAQ07869 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
PPARAQ07869 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
PPARAQ07869 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC31.15■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
PPARAQ07869 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
PPARAQ07869 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC31.02■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.02■■■□□ 2.56
PPARAQ07869 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.97■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PPARAQ07869 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
PPARAQ07869 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC30.91■■■□□ 2.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms