Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRSF11Q05519 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SRSF11Q05519 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SRSF11Q05519 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SRSF11Q05519 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SRSF11Q05519 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SRSF11Q05519 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms