Protein–RNA interactions for Protein: Q04118

PRB3, Basic salivary proline-rich protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB3Q04118 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRB3Q04118 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRB3Q04118 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRB3Q04118 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRB3Q04118 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRB3Q04118 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms