Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
ROM1Q03395 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ROM1Q03395 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ROM1Q03395 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ROM1Q03395 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ROM1Q03395 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ROM1Q03395 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms