Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SPTBN1Q01082 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SPTBN1Q01082 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SPTBN1Q01082 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SPTBN1Q01082 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SPTBN1Q01082 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SPTBN1Q01082 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms