Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
TFAMQ00059 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
TFAMQ00059 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
TFAMQ00059 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
TFAMQ00059 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
TFAMQ00059 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
TFAMQ00059 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
TFAMQ00059 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
TFAMQ00059 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms