Protein–RNA interactions for Protein: P82912

MRPS11, 28S ribosomal protein S11, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS11P82912 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
MRPS11P82912 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MRPS11P82912 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
MRPS11P82912 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MRPS11P82912 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
MRPS11P82912 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms