Protein–RNA interactions for Protein: P78559

MAP1A, Microtubule-associated protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1AP78559 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
MAP1AP78559 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MAP1AP78559 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MAP1AP78559 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MAP1AP78559 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
MAP1AP78559 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
MAP1AP78559 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms