Protein–RNA interactions for Protein: P62316

SNRPD2, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPD2P62316 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SNRPD2P62316 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SNRPD2P62316 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SNRPD2P62316 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SNRPD2P62316 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SNRPD2P62316 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms