Protein–RNA interactions for Protein: P62191

PSMC1, 26S proteasome regulatory subunit 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC1P62191 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
PSMC1P62191 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PSMC1P62191 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PSMC1P62191 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PSMC1P62191 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PSMC1P62191 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PSMC1P62191 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PSMC1P62191 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms