Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ERVS71-1P61550 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
ERVS71-1P61550 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ERVS71-1P61550 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ERVS71-1P61550 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ERVS71-1P61550 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ERVS71-1P61550 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms