Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
AP3S2P59780 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
AP3S2P59780 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
AP3S2P59780 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AP3S2P59780 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
AP3S2P59780 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
AP3S2P59780 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms