Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSX2P58304 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSX2P58304 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
VSX2P58304 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
VSX2P58304 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSX2P58304 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSX2P58304 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
VSX2P58304 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSX2P58304 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSX2P58304 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
VSX2P58304 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSX2P58304 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
VSX2P58304 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
VSX2P58304 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSX2P58304 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
VSX2P58304 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSX2P58304 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSX2P58304 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
VSX2P58304 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSX2P58304 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSX2P58304 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSX2P58304 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSX2P58304 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
VSX2P58304 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
VSX2P58304 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSX2P58304 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
VSX2P58304 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSX2P58304 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSX2P58304 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
VSX2P58304 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSX2P58304 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSX2P58304 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSX2P58304 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSX2P58304 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSX2P58304 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
VSX2P58304 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSX2P58304 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
VSX2P58304 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSX2P58304 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSX2P58304 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSX2P58304 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
VSX2P58304 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSX2P58304 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
VSX2P58304 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
VSX2P58304 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
VSX2P58304 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSX2P58304 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSX2P58304 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
VSX2P58304 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
VSX2P58304 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
VSX2P58304 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSX2P58304 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSX2P58304 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
VSX2P58304 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
VSX2P58304 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSX2P58304 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSX2P58304 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSX2P58304 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
VSX2P58304 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
VSX2P58304 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSX2P58304 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSX2P58304 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSX2P58304 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
VSX2P58304 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSX2P58304 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
VSX2P58304 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSX2P58304 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSX2P58304 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
VSX2P58304 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
VSX2P58304 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSX2P58304 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSX2P58304 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSX2P58304 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
VSX2P58304 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSX2P58304 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSX2P58304 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
VSX2P58304 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSX2P58304 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSX2P58304 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSX2P58304 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSX2P58304 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSX2P58304 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
VSX2P58304 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSX2P58304 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
VSX2P58304 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSX2P58304 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
VSX2P58304 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
VSX2P58304 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSX2P58304 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSX2P58304 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
VSX2P58304 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSX2P58304 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
VSX2P58304 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.8 ms