Protein–RNA interactions for Protein: P56470

LGALS4, Galectin-4, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGALS4P56470 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
LGALS4P56470 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
LGALS4P56470 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LGALS4P56470 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LGALS4P56470 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
LGALS4P56470 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LGALS4P56470 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGALS4P56470 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LGALS4P56470 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LGALS4P56470 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LGALS4P56470 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LGALS4P56470 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGALS4P56470 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LGALS4P56470 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LGALS4P56470 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LGALS4P56470 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
LGALS4P56470 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGALS4P56470 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
LGALS4P56470 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
LGALS4P56470 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms