Protein–RNA interactions for Protein: P55286

CDH8, Cadherin-8, humanhuman

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH8P55286 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDH8P55286 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH8P55286 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDH8P55286 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH8P55286 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH8P55286 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH8P55286 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDH8P55286 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH8P55286 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDH8P55286 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH8P55286 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CDH8P55286 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH8P55286 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CDH8P55286 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH8P55286 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH8P55286 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH8P55286 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH8P55286 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH8P55286 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDH8P55286 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH8P55286 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH8P55286 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH8P55286 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CDH8P55286 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CDH8P55286 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CDH8P55286 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH8P55286 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH8P55286 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CDH8P55286 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH8P55286 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH8P55286 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CDH8P55286 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDH8P55286 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDH8P55286 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CDH8P55286 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH8P55286 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CDH8P55286 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CDH8P55286 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH8P55286 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH8P55286 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH8P55286 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CDH8P55286 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH8P55286 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH8P55286 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CDH8P55286 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CDH8P55286 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH8P55286 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH8P55286 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH8P55286 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH8P55286 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDH8P55286 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDH8P55286 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH8P55286 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDH8P55286 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CDH8P55286 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH8P55286 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDH8P55286 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH8P55286 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH8P55286 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDH8P55286 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH8P55286 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH8P55286 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH8P55286 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH8P55286 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH8P55286 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDH8P55286 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH8P55286 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH8P55286 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDH8P55286 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDH8P55286 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CDH8P55286 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDH8P55286 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH8P55286 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CDH8P55286 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH8P55286 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH8P55286 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH8P55286 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH8P55286 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDH8P55286 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH8P55286 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH8P55286 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH8P55286 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDH8P55286 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH8P55286 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
CDH8P55286 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDH8P55286 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH8P55286 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH8P55286 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH8P55286 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH8P55286 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDH8P55286 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH8P55286 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH8P55286 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH8P55286 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH8P55286 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH8P55286 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDH8P55286 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH8P55286 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDH8P55286 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDH8P55286 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms