Protein–RNA interactions for Protein: P55209

NAP1L1, Nucleosome assembly protein 1-like 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAP1L1P55209 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.08
NAP1L1P55209 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
NAP1L1P55209 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
NAP1L1P55209 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NAP1L1P55209 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NAP1L1P55209 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NAP1L1P55209 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
NAP1L1P55209 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms