Protein–RNA interactions for Protein: P54829

PTPN5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN5P54829 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PTPN5P54829 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
PTPN5P54829 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PTPN5P54829 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PTPN5P54829 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PTPN5P54829 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PTPN5P54829 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms