Protein–RNA interactions for Protein: P54821

PRRX1, Paired mesoderm homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1P54821 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRRX1P54821 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PRRX1P54821 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PRRX1P54821 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PRRX1P54821 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PRRX1P54821 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.32■■□□□ 1
PRRX1P54821 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX1P54821 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PRRX1P54821 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX1P54821 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX1P54821 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX1P54821 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX1P54821 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX1P54821 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX1P54821 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PRRX1P54821 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX1P54821 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX1P54821 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX1P54821 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PRRX1P54821 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX1P54821 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX1P54821 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX1P54821 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX1P54821 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PRRX1P54821 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX1P54821 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PRRX1P54821 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PRRX1P54821 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.5 ms