Protein–RNA interactions for Protein: P54219

SLC18A1, Chromaffin granule amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A1P54219 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC18A1P54219 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC18A1P54219 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC18A1P54219 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SLC18A1P54219 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC18A1P54219 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC18A1P54219 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC18A1P54219 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC18A1P54219 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC18A1P54219 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 271.6 ms