Protein–RNA interactions for Protein: P52655

GTF2A1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2A1P52655 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
GTF2A1P52655 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
GTF2A1P52655 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
GTF2A1P52655 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GTF2A1P52655 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTF2A1P52655 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 RNF126-201ENST00000292363 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTF2A1P52655 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTF2A1P52655 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms