Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GABRA4P48169 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
GABRA4P48169 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GABRA4P48169 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GABRA4P48169 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GABRA4P48169 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GABRA4P48169 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms