Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTGFRP43088 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTGFRP43088 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTGFRP43088 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PTGFRP43088 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PTGFRP43088 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PTGFRP43088 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms