Protein–RNA interactions for Protein: P41180

CASR, Extracellular calcium-sensing receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,078 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASRP41180 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASRP41180 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASRP41180 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASRP41180 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CASRP41180 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASRP41180 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CASRP41180 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASRP41180 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASRP41180 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CASRP41180 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CASRP41180 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASRP41180 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASRP41180 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASRP41180 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CASRP41180 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASRP41180 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASRP41180 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CASRP41180 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASRP41180 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASRP41180 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CASRP41180 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASRP41180 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASRP41180 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASRP41180 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CASRP41180 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASRP41180 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASRP41180 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CASRP41180 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASRP41180 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASRP41180 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASRP41180 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASRP41180 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CASRP41180 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CASRP41180 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CASRP41180 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASRP41180 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CASRP41180 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASRP41180 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASRP41180 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASRP41180 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASRP41180 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CASRP41180 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASRP41180 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASRP41180 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASRP41180 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASRP41180 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CASRP41180 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CASRP41180 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASRP41180 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASRP41180 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CASRP41180 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASRP41180 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CASRP41180 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CASRP41180 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CASRP41180 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASRP41180 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CASRP41180 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASRP41180 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CASRP41180 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASRP41180 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASRP41180 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CASRP41180 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASRP41180 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASRP41180 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CASRP41180 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASRP41180 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASRP41180 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CASRP41180 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CASRP41180 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASRP41180 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CASRP41180 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CASRP41180 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CASRP41180 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASRP41180 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASRP41180 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASRP41180 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CASRP41180 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CASRP41180 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASRP41180 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CASRP41180 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms