Protein–RNA interactions for Protein: P35527

KRT9, Keratin, type I cytoskeletal 9, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT9P35527 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT9P35527 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT9P35527 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
KRT9P35527 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT9P35527 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT9P35527 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT9P35527 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
KRT9P35527 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT9P35527 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT9P35527 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
KRT9P35527 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
KRT9P35527 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT9P35527 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
KRT9P35527 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT9P35527 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT9P35527 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT9P35527 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT9P35527 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
KRT9P35527 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT9P35527 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT9P35527 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
KRT9P35527 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KRT9P35527 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT9P35527 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KRT9P35527 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT9P35527 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT9P35527 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
KRT9P35527 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
KRT9P35527 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT9P35527 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT9P35527 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT9P35527 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT9P35527 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
KRT9P35527 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT9P35527 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT9P35527 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT9P35527 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT9P35527 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KRT9P35527 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT9P35527 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT9P35527 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT9P35527 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
KRT9P35527 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT9P35527 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT9P35527 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KRT9P35527 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
KRT9P35527 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
KRT9P35527 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
KRT9P35527 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT9P35527 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT9P35527 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
KRT9P35527 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT9P35527 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT9P35527 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT9P35527 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT9P35527 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT9P35527 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KRT9P35527 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT9P35527 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT9P35527 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
KRT9P35527 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT9P35527 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
KRT9P35527 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT9P35527 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT9P35527 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT9P35527 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
KRT9P35527 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT9P35527 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT9P35527 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT9P35527 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
KRT9P35527 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT9P35527 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT9P35527 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT9P35527 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
KRT9P35527 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
KRT9P35527 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT9P35527 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
KRT9P35527 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT9P35527 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
KRT9P35527 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KRT9P35527 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT9P35527 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
KRT9P35527 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
KRT9P35527 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT9P35527 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
KRT9P35527 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KRT9P35527 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT9P35527 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT9P35527 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT9P35527 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
KRT9P35527 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT9P35527 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
KRT9P35527 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms