Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HOXC12P31275 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HOXC12P31275 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HOXC12P31275 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HOXC12P31275 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXC12P31275 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXC12P31275 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms