Protein–RNA interactions for Protein: P31269

HOXA9, Homeobox protein Hox-A9, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA9P31269 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
HOXA9P31269 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.04
HOXA9P31269 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
HOXA9P31269 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HOXA9P31269 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA9P31269 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA9P31269 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA9P31269 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA9P31269 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA9P31269 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA9P31269 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA9P31269 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA9P31269 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA9P31269 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA9P31269 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA9P31269 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.56■■■□□ 2
HOXA9P31269 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA9P31269 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA9P31269 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA9P31269 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA9P31269 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA9P31269 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA9P31269 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA9P31269 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA9P31269 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA9P31269 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA9P31269 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA9P31269 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA9P31269 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA9P31269 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA9P31269 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA9P31269 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HOXA9P31269 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms