Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC33.31■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
GTF2E1P29083 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.21■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
GTF2E1P29083 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.17■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC33.16■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
GTF2E1P29083 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC33.12■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
GTF2E1P29083 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.05■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.01■■■□□ 2.88
GTF2E1P29083 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.97■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC32.95■■■□□ 2.87
GTF2E1P29083 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.93■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
GTF2E1P29083 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms