Protein–RNA interactions for Protein: P28300

LOX, Protein-lysine 6-oxidase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXP28300 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOXP28300 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOXP28300 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
LOXP28300 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXP28300 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXP28300 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXP28300 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
LOXP28300 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXP28300 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXP28300 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXP28300 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXP28300 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
LOXP28300 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXP28300 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXP28300 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXP28300 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
LOXP28300 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXP28300 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXP28300 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXP28300 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
LOXP28300 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
LOXP28300 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXP28300 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXP28300 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXP28300 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXP28300 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
LOXP28300 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXP28300 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
LOXP28300 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXP28300 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXP28300 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXP28300 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LOXP28300 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXP28300 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXP28300 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXP28300 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LOXP28300 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXP28300 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LOXP28300 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXP28300 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LOXP28300 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
LOXP28300 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXP28300 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
LOXP28300 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
LOXP28300 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXP28300 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXP28300 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
LOXP28300 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXP28300 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXP28300 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXP28300 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
LOXP28300 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LOXP28300 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LOXP28300 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LOXP28300 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LOXP28300 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LOXP28300 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LOXP28300 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LOXP28300 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LOXP28300 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LOXP28300 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LOXP28300 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LOXP28300 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LOXP28300 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXP28300 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXP28300 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXP28300 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXP28300 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LOXP28300 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXP28300 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXP28300 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LOXP28300 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
LOXP28300 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LOXP28300 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LOXP28300 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LOXP28300 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LOXP28300 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LOXP28300 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LOXP28300 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LOXP28300 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LOXP28300 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LOXP28300 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXP28300 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LOXP28300 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXP28300 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXP28300 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXP28300 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXP28300 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LOXP28300 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LOXP28300 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms