Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NFKBIAP25963 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NFKBIAP25963 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
NFKBIAP25963 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NFKBIAP25963 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
NFKBIAP25963 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NFKBIAP25963 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 176.7 ms