Protein–RNA interactions for Protein: P25786

PSMA1, Proteasome subunit alpha type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA1P25786 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PSMA1P25786 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PSMA1P25786 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PSMA1P25786 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PSMA1P25786 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PSMA1P25786 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PSMA1P25786 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms