Protein–RNA interactions for Protein: P25054

APC, Adenomatous polyposis coli protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCP25054 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
APCP25054 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.27
APCP25054 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
APCP25054 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
APCP25054 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
APCP25054 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
APCP25054 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
APCP25054 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
APCP25054 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APCP25054 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
APCP25054 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
APCP25054 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
APCP25054 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
APCP25054 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
APCP25054 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
APCP25054 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
APCP25054 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCP25054 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCP25054 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCP25054 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
APCP25054 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCP25054 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCP25054 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCP25054 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
APCP25054 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
APCP25054 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
APCP25054 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
APCP25054 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APCP25054 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
APCP25054 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
APCP25054 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCP25054 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCP25054 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCP25054 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCP25054 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
APCP25054 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APCP25054 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APCP25054 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
APCP25054 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
APCP25054 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCP25054 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCP25054 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCP25054 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
APCP25054 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APCP25054 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
APCP25054 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
APCP25054 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCP25054 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
APCP25054 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCP25054 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
APCP25054 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCP25054 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCP25054 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
APCP25054 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APCP25054 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APCP25054 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
APCP25054 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCP25054 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
APCP25054 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
APCP25054 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
APCP25054 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
APCP25054 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
APCP25054 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
APCP25054 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APCP25054 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
APCP25054 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
APCP25054 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
APCP25054 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
APCP25054 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCP25054 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCP25054 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCP25054 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCP25054 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCP25054 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
APCP25054 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
APCP25054 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APCP25054 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APCP25054 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APCP25054 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
APCP25054 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
APCP25054 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
APCP25054 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
APCP25054 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCP25054 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCP25054 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
APCP25054 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
APCP25054 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCP25054 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCP25054 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCP25054 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
APCP25054 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms