Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP6V1B2P21281 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATP6V1B2P21281 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATP6V1B2P21281 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATP6V1B2P21281 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ATP6V1B2P21281 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ATP6V1B2P21281 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms