Protein–RNA interactions for Protein: P20337

RAB3B, Ras-related protein Rab-3B, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3BP20337 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAB3BP20337 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
RAB3BP20337 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAB3BP20337 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAB3BP20337 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAB3BP20337 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms