Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PTPN1P18031 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PTPN1P18031 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PTPN1P18031 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PTPN1P18031 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PTPN1P18031 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PTPN1P18031 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PTPN1P18031 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms