Protein–RNA interactions for Protein: P10451

SPP1, Osteopontin, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP1P10451 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SPP1P10451 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
SPP1P10451 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPP1P10451 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SPP1P10451 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPP1P10451 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SPP1P10451 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPP1P10451 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SPP1P10451 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPP1P10451 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPP1P10451 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPP1P10451 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SPP1P10451 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SPP1P10451 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPP1P10451 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SPP1P10451 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPP1P10451 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPP1P10451 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPP1P10451 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SPP1P10451 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SPP1P10451 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPP1P10451 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SPP1P10451 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPP1P10451 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPP1P10451 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SPP1P10451 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SPP1P10451 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPP1P10451 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SPP1P10451 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPP1P10451 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPP1P10451 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPP1P10451 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPP1P10451 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPP1P10451 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPP1P10451 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SPP1P10451 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPP1P10451 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPP1P10451 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SPP1P10451 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPP1P10451 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SPP1P10451 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPP1P10451 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPP1P10451 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SPP1P10451 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPP1P10451 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SPP1P10451 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPP1P10451 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SPP1P10451 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SPP1P10451 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPP1P10451 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPP1P10451 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPP1P10451 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPP1P10451 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPP1P10451 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SPP1P10451 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPP1P10451 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPP1P10451 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
SPP1P10451 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPP1P10451 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPP1P10451 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPP1P10451 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPP1P10451 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPP1P10451 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SPP1P10451 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPP1P10451 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SPP1P10451 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPP1P10451 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPP1P10451 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPP1P10451 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPP1P10451 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SPP1P10451 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SPP1P10451 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPP1P10451 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SPP1P10451 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPP1P10451 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SPP1P10451 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPP1P10451 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SPP1P10451 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPP1P10451 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPP1P10451 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SPP1P10451 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SPP1P10451 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPP1P10451 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPP1P10451 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPP1P10451 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SPP1P10451 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPP1P10451 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SPP1P10451 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SPP1P10451 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPP1P10451 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SPP1P10451 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPP1P10451 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SPP1P10451 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.1 ms