Protein–RNA interactions for Protein: P0CW71

HSMCR30, Putative metaphase chromosome protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSMCR30P0CW71 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSMCR30P0CW71 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSMCR30P0CW71 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HSMCR30P0CW71 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSMCR30P0CW71 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HSMCR30P0CW71 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSMCR30P0CW71 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HSMCR30P0CW71 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HSMCR30P0CW71 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HSMCR30P0CW71 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HSMCR30P0CW71 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HSMCR30P0CW71 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSMCR30P0CW71 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HSMCR30P0CW71 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms