Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
HOXC4P09017 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
HOXC4P09017 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXC4P09017 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXC4P09017 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXC4P09017 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
HOXC4P09017 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXC4P09017 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms