Protein–RNA interactions for Protein: P04839

CYBB, Cytochrome b-245 heavy chain, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYBBP04839 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYBBP04839 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CYBBP04839 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYBBP04839 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYBBP04839 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYBBP04839 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CYBBP04839 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYBBP04839 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
CYBBP04839 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYBBP04839 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYBBP04839 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYBBP04839 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYBBP04839 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYBBP04839 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYBBP04839 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CYBBP04839 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYBBP04839 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYBBP04839 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYBBP04839 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CYBBP04839 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYBBP04839 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYBBP04839 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CYBBP04839 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CYBBP04839 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CYBBP04839 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYBBP04839 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CYBBP04839 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYBBP04839 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
CYBBP04839 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYBBP04839 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CYBBP04839 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CYBBP04839 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYBBP04839 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYBBP04839 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYBBP04839 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CYBBP04839 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYBBP04839 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYBBP04839 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYBBP04839 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CYBBP04839 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYBBP04839 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYBBP04839 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYBBP04839 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CYBBP04839 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYBBP04839 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CYBBP04839 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CYBBP04839 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYBBP04839 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYBBP04839 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CYBBP04839 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYBBP04839 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CYBBP04839 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYBBP04839 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYBBP04839 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CYBBP04839 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CYBBP04839 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CYBBP04839 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
CYBBP04839 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYBBP04839 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYBBP04839 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYBBP04839 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CYBBP04839 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYBBP04839 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYBBP04839 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CYBBP04839 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYBBP04839 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYBBP04839 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYBBP04839 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CYBBP04839 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CYBBP04839 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CYBBP04839 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYBBP04839 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYBBP04839 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CYBBP04839 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYBBP04839 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYBBP04839 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYBBP04839 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CYBBP04839 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CYBBP04839 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CYBBP04839 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CYBBP04839 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CYBBP04839 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CYBBP04839 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYBBP04839 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CYBBP04839 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
CYBBP04839 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYBBP04839 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYBBP04839 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CYBBP04839 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYBBP04839 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CYBBP04839 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYBBP04839 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYBBP04839 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYBBP04839 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CYBBP04839 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYBBP04839 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYBBP04839 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYBBP04839 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYBBP04839 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CYBBP04839 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.2 ms