Protein–RNA interactions for Protein: P04118

CLPS, Colipase, humanhuman

Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPSP04118 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPSP04118 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPSP04118 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLPSP04118 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPSP04118 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPSP04118 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLPSP04118 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPSP04118 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLPSP04118 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPSP04118 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPSP04118 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
CLPSP04118 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPSP04118 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPSP04118 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPSP04118 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPSP04118 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPSP04118 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLPSP04118 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLPSP04118 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLPSP04118 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPSP04118 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPSP04118 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
CLPSP04118 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPSP04118 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPSP04118 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPSP04118 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLPSP04118 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPSP04118 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPSP04118 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPSP04118 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPSP04118 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPSP04118 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLPSP04118 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPSP04118 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLPSP04118 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPSP04118 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLPSP04118 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLPSP04118 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPSP04118 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPSP04118 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPSP04118 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPSP04118 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLPSP04118 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPSP04118 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPSP04118 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLPSP04118 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPSP04118 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLPSP04118 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLPSP04118 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLPSP04118 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPSP04118 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPSP04118 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLPSP04118 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPSP04118 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLPSP04118 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPSP04118 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPSP04118 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPSP04118 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPSP04118 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLPSP04118 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CLPSP04118 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLPSP04118 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPSP04118 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPSP04118 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLPSP04118 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPSP04118 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPSP04118 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPSP04118 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPSP04118 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLPSP04118 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPSP04118 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLPSP04118 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPSP04118 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPSP04118 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPSP04118 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLPSP04118 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPSP04118 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPSP04118 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPSP04118 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLPSP04118 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPSP04118 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPSP04118 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPSP04118 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPSP04118 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLPSP04118 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPSP04118 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPSP04118 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPSP04118 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLPSP04118 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPSP04118 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPSP04118 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPSP04118 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLPSP04118 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CLPSP04118 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPSP04118 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLPSP04118 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLPSP04118 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPSP04118 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CLPSP04118 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CLPSP04118 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.6 ms