Protein–RNA interactions for Protein: P04040

CAT, Catalase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATP04040 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CATP04040 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CATP04040 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CATP04040 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CATP04040 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CATP04040 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATP04040 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATP04040 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CATP04040 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CATP04040 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CATP04040 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CATP04040 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATP04040 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATP04040 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATP04040 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATP04040 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CATP04040 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CATP04040 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CATP04040 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CATP04040 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CATP04040 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATP04040 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATP04040 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CATP04040 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATP04040 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATP04040 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CATP04040 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CATP04040 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CATP04040 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATP04040 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATP04040 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CATP04040 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CATP04040 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CATP04040 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CATP04040 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATP04040 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATP04040 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CATP04040 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATP04040 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATP04040 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CATP04040 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
CATP04040 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATP04040 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CATP04040 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CATP04040 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CATP04040 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CATP04040 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CATP04040 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATP04040 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATP04040 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATP04040 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATP04040 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CATP04040 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATP04040 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATP04040 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CATP04040 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATP04040 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATP04040 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CATP04040 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATP04040 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATP04040 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATP04040 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CATP04040 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CATP04040 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CATP04040 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATP04040 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATP04040 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CATP04040 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATP04040 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CATP04040 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATP04040 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATP04040 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATP04040 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATP04040 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATP04040 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATP04040 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CATP04040 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATP04040 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATP04040 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATP04040 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CATP04040 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATP04040 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CATP04040 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CATP04040 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CATP04040 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CATP04040 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CATP04040 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CATP04040 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CATP04040 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATP04040 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATP04040 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CATP04040 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CATP04040 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms